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如果你收到交通银行的短信通知，告知你在该银行有5万元的存款存入，首先你需要确认短信的真实性。以下是一些建议。
1、核实短信的真实性：点击短信中的链接或联系交通银行的客服热线，确认这笔交易的具体信息，不要直接回复短信或点击不明链接，以防诈骗。
2、检查账户余额：登录交通银行的网上银行或手机银行，查看账户余额和交易明细，确认这笔存款是否真实存在。
3、确认资金来源：如果这笔存款确实存在，你需要确认资金来源，确保这是你本人预期的存款，如果不是，可能需要进一步调查。
4、关注账户安全：无论这笔存款是否真实，都要关注账户的安全性，确保你的登录信息、交易密码等安全信息没有被泄露，如果发现账户异常，及时联系银行客服。
关于安全性问题，如果经过上述步骤确认短信是真实的，并且资金来源合法，那么存入5万元是安全的，但如果你对短信的真实性有任何疑虑，或者担心诈骗风险，建议直接联系交通银行的客服进行确认和咨询。
对于涉及金钱的短信通知，一定要谨慎对待，确保核实信息的真实性并关注账户安全。